La misión ¿Palkia en el Desierto Haruba?, ha sido distribuida en el país nipón del 1 de Diciembre al 15 de Enero de 2009.
Japón: Del 1 de Diciembre al 15 de Enero 2009
USA: Desde el 6 de Enero del 2009.
Europa: Desde el 12 de Enero del 2009.
Guía de la misión especial:
Comenzarás en la Sala de Reuniones de la Unión Ranger hablando con el Profesor Gobios. Cuando intentes salir, Sete aparecerá y tras él, un Arqueólogo de Pueblo Haruba. Comentarán que algo extraño está sucediendo en toda la región y hay que investigar. Sete irá primero y la misión: ¿Palkia en el Desierto Haruba?, comenzará.
Una vez allí, sigue al Arqueólogo y entrarás en el Templo Hippowdon. Atraviesalo y aparecerás en las afueras de la Unión Ranger sin razón alguna, como si alguien estuviera manipulando el Espacio. Avanza, captura a Magneton y entra en la Unión. Nuevamente aparecerás en otro lugar, la Torre Altru. Sube las escaleras y aparecerás en la Estación Álgida. Entra en la casa superior y aparecerás en la Sierra Croma, captura a Magneton y sal de la cueva. Sal de la Estación Álgida y aparecerás en la Playa Céfiro.
Continua avanzando y aparecerás en el Templo Hippowdon, entra por la fosa nasal izquierda de la estatua y estarás en tu casa. Sal y aparecerás en la Cueva Volcán, avanza y sentirás un temblor. Ve hacia abajo hasta salir de la cueva y aparecerás en las Ruinas de Croma. Lánzate por el agujero y llegarás al final del Templo Hippowdon, donde anteriormente enfréntaste a Cresselia.
Verás al Pokémon que manipula el Espacio, Palkia. Él ha sido el causante de las anormalidades en la región, enfréntalo y por supuesto, véncelo. Ten en cuenta que Palkia puede teleportarse y además puede cambiar tanto el campo como sus ataques a voluntad. Una vez vencido, se irá de regreso a la dimensión donde habita. De regreso en Pueblo Haruba, la misión terminará.