Tomo 1: El peligro de la fama

La aventura comienza cuando Y, cuyo nombre completo es Yvonne Gābena, se acerca a casa de X un día más para convencerle de salir de ella, dado que el protagonista tiene un trauma infantil y lleva años sin pisar el exterior. Trevor trae los 3 Pokémon iniciales para elegirlos con la esperanza de ayudar a Yvonne a sacar a X de su confinamiento. Pero Xerneas e Yveltal aparecen en el pueblo y lo reducen todo a cenizas, en el revuelo los 5 protagonistas pierden o extravían algunos Pokémon y las Pokédex.

Aparece el Team Flare para capturar a los legendarios para usarlos como combustible para su arma secreta e intentan robarle a X el anillo de mega evolución que tiene pero su Kangaskhan lo defiende abriéndole un poco los ojos a X. Sin hogar, emprenden una aventura para describir que es lo que está pasando y por fin se decide a batallar por sus creencias, proteger a sus amigos.

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