Los remakes de los juegos de la segunda generación trajeron remezclas de los temas vistos en los juegos originales adaptados a nuestra época
La aventura comienza en tu pueblo natal, Pueblo Primavera, en su paso a Nintendo DS se le incorporaron unas hélices para comprobar cómo sopla el viento en un lugar tan tranquilo.
La primera ciudad que pisaremos será Ciudad Malva, una ciudad chapada a la antigua, de ambiente oriental y que conserva la Torre Bellsprout. Acorde con el estilo de la ciudad, su Centro Pokémon tiene un techo más oscuro. Esta misma música la comparte con Ciudad Olivo, la ciudad costera que posee puerto y faro.
A Pueblo Azalea acudirás a en más de una ocasión para que César te fabrique más de una PokéBall, también será este el primer lugar en el que te veas las caras con el Team Rocket en su pozo Slowpoke. Esta misma música la comparte con Ciudad Endrino, la última ciudad de Johto que visitarás.
Pero si hay una ciudad por excelencia en Johto, y en el mundo Pokémon en general, esa es Ciudad Trigal. La capital de Johto posee innumerables servicios como el centro comercial, la tienda de bicis, el casino, la Torre Radio, la estación de Magnetotrén o la Terminal Global, incorporada en los remakes.
Ciudad Orquídea es una de las ciudades más tranquilas y no tiene ningún punto de interés a excepción del gimnasio. Sin embargo, en los remakes aparece una salida a la Zona Safari con nuevas rutas.
Si hay una ciudad en Johto ligada al pasado esa es Ciudad Iris, la gente de la zona siempre está dispuesta a contarte lo ocurrido con la Torre Quemada. Además, también encontrarás la Torre Campana (Torre Hojalata en los juegos originales) donde llegado el momento te enfrentarás a Ho-Oh.
La primera ruta de la región no termina en uno como el resto, sino que es la Ruta 29 la que nos abrirá a un mundo enorme que explorar, no se puede decir que sea de las primeras rutas más tranquilas pues está llena de desniveles e hierba alta.
Dos nuevas rutas hicieron su aparición en estos remakes con el fin de llevarnos hacia la nueva Zona Safari de Johto. En la Ruta 47 y 48 esperan unos enormes acantilados, que además guardan un secreto legendario. Como curiosidad, a pesar de ser nuevas rutas poseen una música estilo Game Boy si usamos el Lector GB.
En el momento en que pises la Ruta 27 estarás en Kanto, pero para llegar a la Meseta Añil todavía te queda un largo trecho, pues nada más terminarla está la Ruta 26, la última piedra en el camino para llegar a la Calle Victoria.
¡Encuentro con el Team Rocket! Cada vez que te vea uno de sus reclutas o ejecutivos sonará esta inconfundible música la mar de pegadiza. Y no se puede decir que la vayas a oír poco... Como guiño, en Pokémon Blanco y Negro, el encargado de la música te dejaba también oírla en el edificio de Ciudad Porcelana.
Cuando dos entrenadoras cruzan sus miradas tendrán que tener un combate, esta ley no escrita la cumplen hasta la banda criminal del Team Rocket, aunque no se puede decir que les haga mucha gracia que te metas en sus asuntos...
¿Quién iba a pensar que la tienda de Ciudad Caoba sería el Escondite Rocket? Junto con lance tendrás que infiltrarte dentro y lograr desactivar las estatuas de Persian, para finalmente vencer a los ejecutivos y desbaratar sus planes.